克罗地亚男子国家足球队首次参加1996年欧洲杯就晋级八强，两年后的1998年世界杯更是夺得季军，其中球员达沃·苏克夺得金靴奖；在2018年世界杯中，克罗地亚男足历史性地夺得亚军，创出该队最佳成绩，而队长莫德里奇也夺得该届金球奖。2022年世界杯，克罗地亚再次晋级最后四强，最后取得季军。
由于克罗地亚男足以棋盘图为主的球衣图案在众多运动队中独树一帜，克罗地亚国家足球队在中文世界中也有着“格子军团”的称呼。
足球在20世纪初流行于克罗地亚，但当时克罗地亚未独立，所以克罗地亚的球员在独立之前是代表南斯拉夫的。在上世纪五十至八十年代，克罗地亚球员皆加入南斯拉夫国家足球队参与国际赛。
1991年6月，克罗地亚脱离南斯拉夫独立，立即成立克罗地亚国家足球队。1992年7月3日，克罗地亚正式再度获得国际足球联合会承认后，踢了克罗地亚足球队史上第一场正式国际赛，在墨尔本、阿德莱德和悉尼出战澳大利亚。1994年9月4日，克罗地亚在1996年欧洲杯预选赛拿下了独立后的第一场胜利，以2–0击败爱沙尼亚。
1996年欧洲杯，戈兰·弗拉奥维奇为克罗地亚在国际大型赛事踢进第一颗进球，克罗地亚并靠着这颗进球在小组赛击败了土耳其。克罗地亚接着以3–0击退卫冕冠军丹麦，但在最后一场小组赛败给葡萄牙。克罗地亚在八强赛以1–2败给后来的冠军德国队。
在布拉泽维奇的带领下，克罗地亚队首度参加1998年世界杯预选赛，并靠着附加赛中的两颗进球击败乌克兰，挺进世界杯。在小组赛中，克罗地亚战胜牙买加和日本，但败给阿根廷，以小组第二晋级淘汰赛。克罗地亚一路过关斩将，先在八分之一决赛战踢赢了罗马尼亚，接着在八强战面对当时世界排名第二的德国。克罗地亚以3–0力克德国。半决赛对上法国，上半场两队皆未能攻进球门，到了下半场克罗地亚靠着苏克的进球取得领先优势，但迅速被法国队利利安·图拉姆的进球扳平，之后图拉姆再入一球，终场克罗地亚以1–2吞下败仗。最后克罗地亚以2–1击败荷兰拿下1998年世界杯季军。达沃·苏克以七战进六球的成绩，夺下金靴奖。
1999年1月，克罗地亚在国际足联世界排名中的全球第三，是迄今队史世界排名最高的纪录，1990年代的克罗地亚国家队也因此被称为“黄金世代”。
克罗地亚在2000年欧洲杯出师不利，在预选赛小组赛中排在南斯拉夫和爱尔兰后面，名列小组第三，克罗地亚未能晋级欧洲杯比赛。
在2002年世界杯小组赛中，克罗地亚开赛便以0 – 1小败给了墨西哥，却在后面的赛事中爆冷以2–1击败2000年欧洲杯亚军意大利。然而，在最后一场比赛败给厄瓜多尔，克罗地亚止步于小组赛。
2004年欧洲杯小组赛中，克罗地亚先是分别以0–0和2–2与瑞士和上届冠军法国踢和，但在以2–4败给英格兰后，无缘晋级淘汰赛。
2006年世界杯小组赛，克罗地亚在开幕战败给巴西，并在对日本的比赛中，因为达里奥·斯尔纳在上半场踢失一个点球，终场0–0与日本打平。最后一场小组赛对澳大利亚，比赛中犯规不断，共有三名球员被红牌罚下，终场以2–2踢和，克罗地亚被淘汰。
2008年欧洲杯，克罗地亚在预选赛中拿下分组第一，此外更是两度击败英格兰。这也使得英格兰在预选赛遭到淘汰，英格兰自1984年以来首度无缘晋级欧洲杯。
到2010年代，克罗地亚多了许多球星，使其战力大大提升，如莫德里奇、曼祖基奇、瑞克提奇、奥利奇等。克罗地亚踢法强悍，不少劲旅与其交手都尝下不少苦头。其中在2012年欧洲杯小组赛面对当届冠亚军西班牙及意大利，对西班牙奋战到完场前才失球仅负0-1，而对意大利更能打成1-1平手。
2018年世界杯，克罗地亚状态大勇，首先在小组赛取得三战全胜，并且以3-0大胜传统劲旅阿根廷；到了八分之一决赛和八强淘汰赛克罗地亚皆以点球大战击败丹麦和世界杯东道主俄罗斯，顺利晋级四强；在四强战克罗地亚更在加时以2比1击败热门英格兰，历史上首次打进冠军战，2018年7月15日与法国争夺冠军宝座，同时亦打破了自1998年世界杯三、四名决赛最佳世界杯成绩记录，最终2-4不敌法国获得亚军。2018年世界杯金球奖最终由莫德里奇获得。
2020年欧洲杯，因2019冠状病毒病疫情，延迟一年至2021年才举行。克罗地亚在首场小组赛以0-1不敌英格兰，第二场比赛只能1-1迫和捷克，最后一场小组赛克罗地亚以3-1击败苏格兰，反压捷克取得小组次名晋级八分之一决赛，对手是2008年及2012年的欧洲足球锦标赛冠军西班牙，克罗地亚在比赛最后十分钟连追两球，在法定时间内以3-3迫和西班牙，可惜克罗地亚在加时上半场失掉两球，最后以3-5被西班牙淘汰出局。
2022年世界杯，克罗地亚与上届世界杯季军比利时、摩洛哥和加拿大同组，克罗地亚首仗战平摩洛哥0-0，次仗以4-1反胜加拿大，最后一仗以0-0战平比利时，压倒比利时取得小组次名晋级八分之一决赛。八分之一决赛克罗地亚在法定时间内以1-1迫和日本，最后在点球大战阶段击败日本，晋级八强的克罗地亚面对五届世界杯冠军巴西，克罗地亚在法定90分钟与巴西打和0-0，进入加时赛。克罗地亚在加时上半场被巴西的尼马攻入一球，但在加时下半场取得进球扳平1-1，结果克罗地亚再次在点球大战中获胜淘汰巴西，晋级四强，对战另一支南美劲旅阿根廷。尽管上届世界杯小组赛，克罗地亚曾以3-0击败阿根廷，本届半决赛时克罗地亚被阿根廷以3-0击败，转战三、四名决赛，最终以2比1击败本届黑马摩洛哥，得到季军。